La série Pro Evolution Soccer est connue pour son réalisme et Pro Evolution Soccer 6 regorge de nouvelles fonctionnalités de jeu. L'IA des joueurs a été très largement renforcée, avec des joueurs se déplaçant intelligemment dans l'espace lorsqu'ils n'ont pas le ballon et désignant l'endroit ou placer la passe pour continuer l'attaque. De la même manière, le côté physique a subi quelques retouches, avec des joueurs qui tentent de contourner un défenseur lorsqu'ils reçoivent le ballon et des défenseurs qui doivent apprendre à se décaler légèrement pour éviter de tels gestes.

Shingo 'Seabass' Takatsuka, le créateur de la série, s'est aussi attaché à améliorer le système de tir du nouveau jeu. Les joueurs pourront tenter plus de tirs rapides que dans les versions précédentes tandis que les volées et demi-volées ont été revisitées. Parmi les autres nouveautés, citons la capacité de garder le contrôle du ballon tout en taclant. De nouvelles feintes de passe et autres dribbles en arrière sont également de la partie grâce aux contrôles de dribble améliorés et les têtes ont été modifiées afin de donner aux joueurs plus de latitude sur la façon dont leur tireur saute et touche le ballon de la tête.
Les nouveautés incluent des arbitres plus équilibrés et un choix de nouveaux modes de jeu excitants. Un Défi international vous invite à mener votre pays à la victoire dans une série de tours préliminaires et de phases finales, et un mode Hasard permet aux joueurs de s'adonner à des matchs rapides dont les paramètres sont générés au hasard.
La très adulée Ligue des Masters fait également son retour, permettant aux joueurs de vivre les hauts et les bas de la gestion d'une équipe à travers des années de matchs de compétition.Joueurs vieillissants, blessures et pressions du conseil d'administration se mêlent pour créer un jeu véritablement captivant où seuls les résultats comptent...
Avec ses gestes séduisants et une action réaliste, Pro Evolution Soccer 6 est certain de se démarquer facilement des titres rivaux en alignant une impressionnante série de nouveaux gestes, de clubs sous licence et de modes de jeu.